Von 1990 bis 2005 war Mirtl Klubsekretär bei Austria Salzburg. Er war mitverantwortlich für den Höhenflug der Mozartstädter, der in drei Bundesliga-Meistertiteln und dem Einzug ins UEFA-Cup-Finale 1994 gipfelte.
Nach der Übernahme des Klubs von Red Bull fungierte er 2005 als enger Vertrauerter von Dietrich Mateschitz.
Gemeinsam mit seinem Sohn Philipp baute Mirtl in den vergangenen Jahren eine Berater-Agentur namens "m&m deportivo" auf, dank der einige nun bekannte Namen einst den Sprung aus dem Unterhaus-Fußball ins Profigeschäft schafften - darunter Thomas Goiginger, Marco Grüll, Matthias Seidl und Benedikt Pichler.
